В силу того, что кетоновые тела обладают противоэпилептическим эффектом, увеличение их количества в крови приводит к урежению и даже прекращению эпилептических приступов.
Лечение эпилепсии методом увеличения количества в организме кетоновых тел использовалось еще библейские времена, однако тогда эффект достигался в результате длительного голодания. По этой причине данный подход можно считать лишь прототипом настоящей кетогенной диеты, впервые использованной в 1924 году в клинике Майо Расселом Уайлдером. Активное развитие фармакологии и выход на рынок большого количества противоэпилептических препаратов привело к временному забвению метода. Однако благодаря активной работе проекта Charlie Foundation кетогенная диета вернулась в активную практику и используется по настоящее время.